|
MOLEKULARNA FILOGENETYKA 23 - 25 października 2008 Ośrodek Szkoleniowo-Konferencyjny Exploris, ul. Ciołka 6, Warszawa Podczas warsztatów uczestnicy zapoznają się z poszczególnymi etapami badań od sekwencjonowania próbki DNA do zbudowania i oceny drzewa filogenetycznego. Warsztaty umożliwiają praktyczne zapoznanie się z programami do projektowania starterów, porównywania sekwencji DNA i białek oraz budowy drzew filogenetycznych. Wykłady pozwolą na usystematyzowanie oraz poszerzenie wiedzy z filogenetyki, programów komputerowych oraz ich zastosowania do badań filogenetycznych. Warsztaty skierowane są do osób zamierzających prowadzić badania w oparciu o sekwencje DNA oraz białek, jak również zainteresowanych zastosowaniem nowych sposobów analizy komputerowej do badań prowadzonych klasycznymi metodami. Osoby zainteresowane przebiegiem analizy od pobrania próbki do otrzymania produktu PCR zapraszamy na kurs „Podstawowe metody badań kwasów nukleinowych”, a bezpośrednio z techniką sekwencjonowania na kurs „Sekwencjonowanie i analiza metylacji DNA”.
WYKŁADY Sekwencjonowanie i projektowanie starterów Podstawowe zasady konstruowania drzew filogenetycznych Procedura dopasowywania sekwencji Modele substytucji nukleotydowej Metody identyfikacji i lokalizacji sekwencji kodujących w genomie Metody konstrukcji i ocena wiarygodności drzew Mechanizmy różnicowania ewolucyjnego wśród białek
ĆWICZENIA Projektowanie starterów do reakcji PCR i sekwencjonowania Dobieranie enzymów restrykcyjnych do analizy metodą PCR-RFLP, program NEBCutter Praca z programami do multiple aligment, Clustal W, BLAST i inne Konstruowanie drzew filogenetycznych na podstawie sekwencji genu cytochromu b, program MEGA Praca z programem PHYLIP Analiza zmienności mutacyjnej w białkach · analiza mutacji sprzężonych · trójwymiarowe mapy obszarów zmienności w białkach homologicznych · mapy kontaktów intramolekularnych |
|
Warsztaty |
